Atom Run, İphone, İpad ve Android cihazlar için geliştirilmiş çok yönlü bir platform oyunudur. Oyunun senaryosu ise 2264 yıllarını konu alan ve robot çağlarında geçmektedir.

Teknoloji o kadar ilerlemiş ve robotlar yapay zekaya sahip olmuşlar, dünya üzerindeki mikroplardan oluşan bir hastalık sonucu bütün insanlık yaşamını yitirmiş ve dünya robotlara kalmış.

Robotlar dünyanın yeni sahipleri haline gelseler de onların da bir zayıf noktaları vardır. Radyasyona maruz kalan robotlar kontrolden çıkarak saldırganlaşmaktadırlar. Fakat sadece bir robot radyasyondan etkilenmemektedir. Oyunda Elgo adlı bu radyasyondan etkilenmeyen robotu kontrol ediyoruz ve yeni bir yaşam oluşturmak için gerekli olan atom ve molekülleri toplamaya çıkıyoruz.